NGS (Next Generation Sequencing), también llamada secuenciación masiva, es una tecnología que permite leer millones de fragmentos de ADN simultáneamente. A diferencia de la PCR que busca mutaciones específicas conocidas, NGS analiza genes completos o incluso el genoma entero, detectando cualquier variante presente.
Cómo funciona la secuenciación NGS
La tecnología NGS fragmenta el ADN en millones de trozos pequeños, los secuencia en paralelo y luego reconstruye computacionalmente la secuencia completa comparándola con un genoma de referencia. Este proceso identifica todas las diferencias (variantes) respecto al genoma humano estándar.
Pasos básicos del proceso NGS
- Extracción de ADN: desde sangre, saliva o tejido
- Preparación de librería: fragmentación del ADN y adición de adaptadores
- Secuenciación: lectura simultánea de millones de fragmentos
- Análisis bioinformático: alineamiento y detección de variantes
- Interpretación clínica: clasificación de variantes (patogénicas, benignas, VUS)
Tipos de secuenciación NGS
1. Paneles de genes (Panel NGS)
Analiza un conjunto específico de genes relacionados con una enfermedad o grupo de enfermedades. Por ejemplo:
- Panel cardiovascular: 50-100 genes relacionados con cardiopatías hereditarias
- Panel oncológico: genes de predisposición a cáncer (BRCA1/2, TP53, MLH1...)
- Panel neurológico: epilepsias, ataxias, neuropatías
Ventajas: más económico que exoma/genoma, análisis más rápido (5-10 días), mejor cobertura de genes diana.
2. Exoma completo (WES - Whole Exome Sequencing)
Secuencia todos los exones (regiones codificantes) del genoma humano (~22.000 genes, 2% del genoma total). Detecta el 85% de mutaciones causantes de enfermedades genéticas conocidas.
Indicaciones: enfermedades raras sin diagnóstico tras paneles específicos, fenotipos complejos, diagnóstico diferencial amplio.
3. Genoma completo (WGS - Whole Genome Sequencing)
Secuencia el 100% del ADN, incluidas regiones no codificantes (intrones, promotores, reguladores). Permite detectar variantes estructurales grandes, reordenamientos cromosómicos y variantes en regiones reguladoras.
Uso actual: principalmente investigación y casos complejos sin diagnóstico tras WES.
NGS vs Sanger vs PCR: Comparativa
| Técnica | Alcance | Coste | Tiempo | Cuándo usarla |
|---|---|---|---|---|
| PCR | 1 mutación específica | 20-80€ | 24-48h | Confirmación diagnóstica rápida |
| Sanger | 1 gen completo | 150-300€ | 5-7 días | Validación de variantes NGS |
| Panel NGS | 10-500 genes | 300-800€ | 10-15 días | Diagnóstico diferencial |
| Exoma | ~22.000 genes | 800-1.500€ | 20-30 días | Enfermedades raras sin diagnóstico |
Aplicaciones clínicas de NGS
Diagnóstico de enfermedades genéticas
NGS es la herramienta de elección para:
- Enfermedades con gran heterogeneidad genética: sordera hereditaria (más de 100 genes), epilepsias, discapacidad intelectual
- Fenotipos inespecíficos: cuando los síntomas no apuntan a un gen concreto
- Familias con varios afectados: permite identificar la mutación familiar y estudiar portadores
Oncología de precisión
Los paneles oncológicos NGS identifican mutaciones somáticas en tumores que pueden ser diana de terapias dirigidas:
- Cáncer de mama/ovario: mutaciones BRCA1/2 → inhibidores PARP
- Melanoma: mutación BRAF V600E → vemurafenib
- Cáncer de pulmón: mutaciones EGFR → inhibidores de tirosina quinasa
Diagnóstico prenatal (NIPT)
La secuenciación del ADN fetal libre circulante en sangre materna detecta aneuploidías (síndrome de Down, Edwards, Patau) con 99% de sensibilidad. Más sobre NIPT aquí.
Interpretación de resultados NGS
Un análisis NGS puede reportar decenas o cientos de variantes. El trabajo bioinformático y clínico consiste en clasificarlas según su patogenicidad:
| Clasificación ACMG | Significado | Acción clínica |
|---|---|---|
| Patogénica | Causa enfermedad (evidencia fuerte) | Diagnóstico confirmado |
| Probablemente patogénica | Muy probablemente causal | Actuar como diagnóstico |
| VUS (Variante de significado incierto) | No se puede determinar | Vigilancia, estudios familiares |
| Probablemente benigna | Muy probablemente no causal | No requiere acción |
| Benigna | No causa enfermedad | No reportar |
Entre el 20-40% de los exomas sin diagnóstico previo reportan al menos una VUS. En estos casos, el seguimiento y la reclasificación futura pueden aportar diagnóstico.
Limitaciones de NGS
A pesar de su potencia, NGS no detecta todo:
- Expansiones de tripletes: Huntington, ataxias SCA, distrofia miotónica (requieren PCR específica)
- Variantes en regiones repetitivas: baja cobertura en zonas de homopolímeros
- Mosaicismos de bajo porcentaje: <10-20% pueden no detectarse
- Variantes estructurales complejas: inversiones, translocaciones balanceadas (requieren array CGH o cariotipo)
Más sobre array CGH y cariotipo aquí.
NGS en POLiGEN
Consulta con POLiGEN el panel que solicita tu especialista. Antes de contratar, confirma disponibilidad, laboratorio responsable, genes incluidos y limitaciones. Los siguientes apartados son orientativos y no constituyen un presupuesto:
- Paneles cardiovasculares: miocardiopatías, canalopatías, aortopatías
- Paneles neurológicos: epilepsia, ataxia, neuropatías, distrofias musculares
- Paneles metabólicos: errores congénitos del metabolismo
- Paneles de cáncer hereditario: mama/ovario, colon, melanoma
Enlace externo: Para profundizar en NGS, consulta NIH - Coste de secuenciación NGS.
⚠️ Aviso importante:
Este artículo tiene fines informativos y educativos. La información aquí presentada no sustituye el consejo médico, veterinario o el diagnóstico profesional. Consulte siempre con un especialista cualificado antes de tomar decisiones sobre salud o tratamientos.
Para consultas sobre pruebas genéticas, solicite información detallada sobre disponibilidad, tipo de muestra necesaria, laboratorio responsable del análisis, plazo de entrega e interpretación del informe.
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